文字コードの種類は何故複数あるのでしょうか？

124 ：デフォルトの名無しさん：2007/08/13(月) 14:54:27 .net

Windows上でperlのCGIを作成していて、
ファイルの保存時に、漢字コードを指定しないと
保存できないのですが、
シフトJISと
JISと
EUCと、
どれを選択したらいいのでしょうか？
作成後はFFFTPでレンタルサーバーにアップロードしますが、
そのレンタルサーバーは当然UNIXなので、
UNIXで動かすということを考えればEUCで保存したほうが
いいのですか？
あと、C5の問題（表とか）を考えれば
シフトJISだと
表￥
っていちいち書かないと文字化けしますが、
EUCだったらそんな余計なこと考えないでいいと
いう記述も見つけました。
だったらEUCで保存しようかな？と思いましたが
それだとWindows上でソースコードの変更作業するときに
漢字が文字化けしないですか？
だってWindowｓはシフトJISしか取り扱えないのだから。
結局何で保存すればいいのでしょうか？